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植物硬組織切片甲苯胺藍染色 硬組織切片針對未經(jīng)化學試劑軟化的硬組織，能很好地保留木質(zhì)部結(jié)構(gòu)和成分。甲苯胺藍（Toluidine Blue O）是一種多色堿性染料，可使植物組織和細胞的不同成分染成不同的顏色。木質(zhì)化部分呈藍綠色，韌皮部呈藍紫色，其他部分呈淺的藍綠色。

植物硬組織切片番紅固綠染色 硬組織切片針對未經(jīng)化學試劑軟化的硬組織，能很好地保留木質(zhì)部結(jié)構(gòu)和成分。番紅固綠染色能顯示植物木質(zhì)部，其中韌皮部形成層等組織結(jié)構(gòu)呈綠色，木質(zhì)化木栓化的結(jié)構(gòu)呈紅色。

番紅-固綠染色（軟骨）在涉及關(guān)節(jié)軟骨及軟骨下骨的形態(tài)學研究中，常需聯(lián)合使用多種染料以顯示其組織學結(jié)構(gòu)。其中，起源于上世紀60年代的番紅O（safranin O）-固綠（fast green）染色因可以直觀反映關(guān)節(jié)軟骨、軟骨下骨和骨組織的結(jié)構(gòu)而備受青睞。軟骨呈紅色，成骨呈綠色。

LFB染色又稱固藍染色（FAST BLUE），一般染腦、脊髓、外周神經(jīng)。神經(jīng)髓鞘呈亮藍色，背景無色至淺藍色，主要用來顯示神經(jīng)髓鞘的形態(tài)結(jié)構(gòu)及病理變化

尼氏染色 Franna Nissl （1860-1919） 1892年創(chuàng)立了Nissl染色法，以發(fā)現(xiàn)Nissl小體和Nissl變性而聞名它能夠清楚地顯示軟骨形態(tài)潮線等結(jié)構(gòu)，觀察軟骨組織是否有損傷。能將組織內(nèi)的肥大細胞清晰地顯示出來，便于觀察肥大細胞的數(shù)量分布變化情況及觀察肥大細胞是否有脫顆?，F(xiàn)象。

阿利新藍染色（AB染色），石蠟切片技術(shù)里用以區(qū)分羧基黏液還是硫酸化黏液物質(zhì)，常用于黏液性上皮腫瘤的鑒別和證明腫瘤是否含有粘液物質(zhì);在骨組織中能有夠清晰的標記出軟骨。骨組織的軟骨和腸組織的酸性粘液呈藍色，細胞核呈紅色。（若不復染核固紅，則背景和細胞核均無色）

EVG染色 組織被含有三氯化鐵和碘的蘇木精染色再用過量的媒染劑三氯化鐵中斷組織與染料的結(jié)合，染料被分化液中的大量媒染劑吸引,使其從組織中清除。彈性纖維對鐵蘇木精具有較強的吸引力使染料能比其他組織保留更久而達到染色的效果。

瑞氏姬姆薩染色 用于生物染色劑，如原生質(zhì)的染色，染色目的多為觀察凋亡細胞和血細胞，骨髓細胞以及受虐原蟲或幽門螺旋桿菌感染的胃腸肺肝脾等組織。實驗中多用于區(qū)分白細胞，并計數(shù)分析。