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緩沖液在電泳過(guò)程中的一個(gè)作用是維持合適的pH。電泳時(shí)正極與負(fù)極都會(huì)發(fā)生電解反應(yīng)，正極發(fā)生的是氧化反應(yīng)（4OH--4e->2H2O+O2)，負(fù)極發(fā)生的是還原反應(yīng)（4H++4e->2H2)，長(zhǎng)時(shí)間的電泳將使正極變酸，負(fù)極變堿。一個(gè)好的緩沖系統(tǒng)應(yīng)有較強(qiáng)的緩沖能力，使溶液兩極的pH保持基本不變。
電泳緩沖液的另一個(gè)作用是使溶液具有一定的導(dǎo)電性，以利于DNA分子的遷移，例如，一般電泳緩沖液中應(yīng)含有0.01-0.04mol/L的Na+離子，Na+離子的濃度太低時(shí)電泳速度變慢；太高時(shí)就會(huì)造成過(guò)大的電流使膠發(fā)熱甚至熔化。

TAE緩沖液，25X濃縮液
電泳緩沖液還有一個(gè)組分是EDTA，加入濃度為1-2mmol/L，目的是螯合Mg2+ 等離子，防止電泳時(shí)激活 DNA酶，此外還可防止Mg2+離子與核酸生成沉淀。
TAE是使用zui廣泛的緩沖系統(tǒng)。其特點(diǎn)是超螺旋在其中電泳時(shí)更符合實(shí)際相對(duì)分子質(zhì)量（TBE中電泳時(shí)測(cè)出的相對(duì)分子質(zhì)量會(huì)大于實(shí)際分子質(zhì)量），且雙鏈線狀DNA在其中的遷移率較其他兩種緩沖液快約10%，電泳大于13kb的片段時(shí)用TAE緩沖液將取得更好的分離效果，此外，回收DNA片段時(shí)也易用TAE緩沖系統(tǒng)進(jìn)行電泳。TAE的缺點(diǎn)是緩沖容量小，長(zhǎng)時(shí)間電泳不可選用，除非有循環(huán)裝置使兩極的緩沖液得到交換。
 

TAE緩沖液，25X濃縮液的配方：

50×TAE Buffer 配制方法：
1。稱量Tris 242g，Na2EDTA.2H2O37.2g于1L燒杯中；
2。向燒杯中加入約800ml去離子水，充分?jǐn)嚢杈鶆颍?br />3。加入57.1ml的冰乙酸，充分溶解；
4。用NaOH調(diào)pH至8.3，加去離子水定容至1L后，室溫保存。
使用時(shí)稀釋50倍或100倍 即1×TAE Buffer 或 0.5×TAE[2]